Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp3P58854 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms