Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl4P58321 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms