Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms