Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms