Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5g3P56384 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp5g3P56384 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms