Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2bP55271 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms