Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrlP54846 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrlP54846 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrlP54846 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrlP54846 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NrlP54846 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NrlP54846 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrlP54846 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NrlP54846 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrlP54846 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms