Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms