Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux1P53564 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cux1P53564 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms