Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbtP53395 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbtP53395 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbtP53395 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbtP53395 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbtP53395 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DbtP53395 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DbtP53395 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms