Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lbx1P52955 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms