Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndst2P52850 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndst2P52850 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms