Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms