Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms