Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcnfP51944 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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