Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms