Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfP51642 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfP51642 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CntfP51642 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CntfP51642 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntfP51642 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms