Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MipP51180 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MipP51180 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.1 ms