Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa10P50708 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms