Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TubP50586 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TubP50586 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TubP50586 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TubP50586 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TubP50586 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TubP50586 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TubP50586 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms