Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpdP50404 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms