Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhaP50136 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms