Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms