Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtpreP49446 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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