Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epb42P49222 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epb42P49222 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms