Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CitP49025 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CitP49025 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CitP49025 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms