Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prox1P48437 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms