Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms