Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms