Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13P47963 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl13P47963 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms