Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scg3P47867 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg3P47867 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms