Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gli1P47806 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms