Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3caP42337 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3caP42337 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3caP42337 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3caP42337 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3caP42337 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3caP42337 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms