Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TfamP40630 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TfamP40630 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TfamP40630 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TfamP40630 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms