Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms