Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms