Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab17P35292 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab17P35292 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms