Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms