Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp4P35123 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp4P35123 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms