Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptk2P34152 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms