Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nedd1P33215 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd1P33215 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms