Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms