Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pabpc1P29341 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms