Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxrbP28704 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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