Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BgnP28653 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BgnP28653 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BgnP28653 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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