Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col2a1P28481 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col2a1P28481 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms