Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Hoxd10P28359 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd10P28359 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms