Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd9P28357 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd9P28357 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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