Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms