Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LoxP28301 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LoxP28301 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LoxP28301 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LoxP28301 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LoxP28301 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LoxP28301 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LoxP28301 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LoxP28301 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.6 ms